Detalles de la búsqueda
1.
Assessing the feasibility of statistical inference using synthetic antibody-antigen datasets.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 23(1)2024 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38563699
2.
immuneSIM: tunable multi-feature simulation of B- and T-cell receptor repertoires for immunoinformatics benchmarking.
Bioinformatics
; 36(11): 3594-3596, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32154832
3.
Assessing graph-based read mappers against a baseline approach highlights strengths and weaknesses of current methods.
BMC Genomics
; 21(1): 282, 2020 Apr 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32252628
4.
Graph Peak Caller: Calling ChIP-seq peaks on graph-based reference genomes.
PLoS Comput Biol
; 15(2): e1006731, 2019 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30779737
5.
Coloc-stats: a unified web interface to perform colocalization analysis of genomic features.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W186-W193, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29873782
6.
Coordinates and intervals in graph-based reference genomes.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 263, 2017 May 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28521770
7.
The Genomic HyperBrowser: an analysis web server for genome-scale data.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W133-41, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23632163
8.
Vitamin D receptor ChIP-seq in primary CD4+ cells: relationship to serum 25-hydroxyvitamin D levels and autoimmune disease.
BMC Med
; 11: 163, 2013 Jul 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23849224
9.
DagSim: Combining DAG-based model structure with unconstrained data types and relations for flexible, transparent, and modularized data simulation.
PLoS One
; 18(4): e0284443, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37058511
10.
Profiling the baseline performance and limits of machine learning models for adaptive immune receptor repertoire classification.
Gigascience
; 112022 05 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35639633
11.
simAIRR: simulation of adaptive immune repertoires with realistic receptor sequence sharing for benchmarking of immune state prediction methods.
Gigascience
; 122022 12 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37848619
12.
Reference-based comparison of adaptive immune receptor repertoires.
Cell Rep Methods
; 2(8): 100269, 2022 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36046619
13.
The differential disease regulome.
BMC Genomics
; 12: 353, 2011 Jul 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21736759
14.
A compact vocabulary of paratope-epitope interactions enables predictability of antibody-antigen binding.
Cell Rep
; 34(11): 108856, 2021 03 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33730590
15.
Author Correction: Human somatic cell mutagenesis creates genetically tractable sarcomas.
Nat Genet
; 52(4): 464, 2020 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32094913
16.
Assessment of composite motif discovery methods.
BMC Bioinformatics
; 9: 123, 2008 Feb 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18302777
17.
Disease-driving CD4+ T cell clonotypes persist for decades in celiac disease.
J Clin Invest
; 128(6): 2642-2650, 2018 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29757191
18.
EBNA2 binds to genomic intervals associated with multiple sclerosis and overlaps with vitamin D receptor occupancy.
PLoS One
; 10(4): e0119605, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25853421
19.
Human somatic cell mutagenesis creates genetically tractable sarcomas.
Nat Genet
; 46(9): 964-72, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25129143
20.
Integrating multiple oestrogen receptor alpha ChIP studies: overlap with disease susceptibility regions, DNase I hypersensitivity peaks and gene expression.
BMC Med Genomics
; 6: 45, 2013 Oct 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24171864